Le nom de famille Noto et ses dérivés — Nota, Noti, Note, Notini, Notaro et probablement d'autres — ont leur origine dans le toponyme Noto, ville de la province de Syracuse, en Sicile, connue pour son centre historique baroque, déclaré patrimoine mondial par l'UNESCO en 2002.

Le toponyme Noto dérive de l'ancien nom grec Netum ou Neiton (en grec ancien Νέτον ou Νεῖτον), qui signifie « lieu de venins », en référence aux eaux marécageuses, tenues pour insalubres et de ce fait associées à la présence de serpents et d'autres animaux venimeux. Le nom Netum fut ensuite latinisé en Nettum, puis en Nota.

Le nom est principalement réparti en Italie, présent dans plusieurs régions, en particulier en Sicile, mais aussi en Lombardie, dans le Piémont, en Calabre, en Campanie et ailleurs. Il n'est toutefois pas particulièrement commun et ne figure pas parmi les cent noms de famille italiens les plus répandus.

Selon des sources historiques, comme les notes du chroniqueur et généalogiste du XVIIe siècle Filadelfo Mugnos, les premiers membres connus furent les chevaliers palermitains Nicolò et Giacomo (de) Noto, père et fils, originaires de la ville de Noto. Le Dictionnaire historico-héraldique des familles nobles et notables italiennes de Giovanni Battista di Crollalanza mentionne les familles Noto, y compris celle de Malte — dont le blason était d'argent au lion de sable — et celle de Palerme.