Le nom de famille Pergolesi et ses variantes dérivent du toponyme Pergola, commune de la province de Pesaro et Urbino, dans la région des Marches. Le nom de la commune provient du latin pergŭla, terme qui désignait une structure légère ou un appentis — origine de l'italien pèrgola —, construction habituelle dans les zones agricoles, en particulier comme support pour les vignes et les plantes grimpantes. Ce trait caractéristique de l'environnement rural donna son nom au lieu, ensuite fixé comme toponyme.

À partir de ce toponyme naquirent différents noms de famille d'origine géographique, qui identifiaient les personnes venues de Pergola. Au fil des siècles, le nom de base Pergola donna lieu à diverses variantes, formées selon la région d'établissement et les suffixes locaux.

La forme Pergola est la forme directe du toponyme, présente dans toute l'Italie avec une plus forte présence dans les Marches et un foyer secondaire en Basilicate. Pergolini (surtout dans les Marches) et Pergolotti (rare, aire d'Ancône) sont des branches familiales dérivées, tout comme Pergoletti dans le centre de l'Italie. Pergolesi — la forme la plus célèbre — indique une provenance directe (« natif de Pergola ») : l'exemple iconique est le compositeur Giovanni Battista Pergolesi (1710-1736), dont la famille était originaire de Pergola (bien qu'il fût né à Jesi). Pergolese, variante rare de la précédente, se trouve principalement dans le sud de l'Italie.

D'autres variantes reflètent la diffusion du nom hors de son noyau des Marches : Pergolari (présence sporadique dans le centre), Pergolis (au Frioul-Vénétie Julienne, avec une adaptation du Nord-Est) et Pergolizzi (en Sicile, avec le suffixe -izzi propre au Sud). La forme Della Pergola, documentée en particulier dans les Marches, indique une appartenance historique au lieu et est fréquente parmi les familles juives italiennes.