Les auteurs s'accordent sur l'origine grecque du nom. E. Rossoni signale qu'il dériverait du terme grec kalogheros, qui signifie « beau vieillard », titre réservé en particulier aux moines et aux personnes de respect. Dans certains cas, il pourrait procéder du nom propre grec Kalogeros, ou bien de toponymes qui contiennent la racine Calogero, comme San Calogero dans les zones de Vibo Valentia et d'Agrigente, ou Piano Calogero dans la zone de Palerme.

P. Durante propose en revanche une étymologie différente : le grec kalos hieros, avec le sens de « bon prêtre » ou « moine », ou bien son usage comme nom propre.

Rossoni atteste des indices de la fixation comme nom de famille dès le XVIe siècle à Lizzanello, dans la zone de Lecce, avec la forme Calogiuri, et dans la seconde moitié du XVIIIe siècle avec la variante Caligiuri. Géographiquement, la forme Caligiuri se concentre en Calabre, en particulier dans le sud de la zone de Cosenza, de Catanzaro et de Crotone, tandis que Calogero prédomine dans l'est de la Sicile et dans la zone de Reggio de Calabre.