Les auteurs s'accordent à considérer que ce nom de famille appartient au sud de l'Italie et dérive du nom de base Ponte, intégrant un groupe de formes altérées et hypocoristiques qui inclut aussi Pontello, Pontèlli, Ponticiello, Ponticelli, Pontini et Pontoni. La base commune est constituée des toponymes formés sur Ponte et Ponti, très répandus dans toute l'Italie, qui désignent des localités caractérisées par la présence d'un pont ou leur situation près de l'un d'eux : parmi eux, Ponticelli (Naples, Rieti), Pontiròlo Nuovo (Bergame) et Ponte Alto (Belluno).

Le suffixe -illo est un diminutif affectueux propre au sud de l'Italie, en particulier de la Campanie, de la Calabre et des Pouilles, et renvoie à la provenance d'un lieu lié à un petit pont ou à un ancêtre associé à une localité appelée Ponte. R. Sgaramella documente le nom en Calabre, en Basilicate et à Lucera (Foggia), avec la première attestation connue en 1769 — A. Pontillo, de Foggia — et, dans la variante Puntillo, en 1819, avec Luigi Puntillo.