Les auteurs divergent sur l'origine de ce nom de famille. E. Rossoni le fait dériver du nom gothique Bato, Batonis, et rappelle deux chefs historiques qui l'ont porté : Baton des Dèsidiates et Baton des Breuces, tous deux à la tête de soulèvements qui, à l'époque d'Auguste, affrontèrent en Pannonie le général Tibère. Rossoni situe le nom principalement en Toscane : la zone de Florence — avec une présence à Florence même et à Pelago — et la zone de Prato.

V. Blunda, en revanche, propose une origine différente pour la forme sicilienne du nom : il le fait dériver du grec ábbas, « abbé », titre ecclésiastique de tradition byzantine conservé dans l'onomastique de Sicile, surtout sous les formes Abba et Abbate. Selon Blunda, Bati représenterait une contraction de ce même étymon, transformée par la transmission familiale.

Le nom présente donc des origines indépendantes selon les régions d'Italie : une souche toscane liée à l'anthroponymie germanique et une souche sicilienne liée au vocabulaire ecclésiastique d'influence grecque.